南方医科大学顺德医院感染性疾病科是顺德区医学重点专科，广东省住院医师规范化培训基地，是顺德区政府指定收治各类感染性疾病的定点科室，是顺德地区规模大、技术力量强的感染性疾病诊疗中心。
科室设立在医院独立区域（7号楼），病房严格按照感染性疾病要求的“三区两通道”实施管理，设立消化道病区、呼吸道病区和发热病区；学科设立以下亚专科：病毒性肝炎与肝衰竭、脂肪肝、艾滋病、结核、细菌真菌感染、发热待查。门诊设有发热门诊、肝病门诊、脂肪肝与丙肝门诊、乙肝临床治愈门诊、爱心门诊、感染病（含肠道）门诊及HIV暴露后阻断门诊。
